Após várias sugestões feitas pela assembleia de fieis, a que se destacou foi Santo Antônio, denominação essa que foi escolhida pela maioria dos fieis por causa da irrevogável fama de evangelizador que acompanha o santo.

Com a necessidade de ter um local de referência para celebrações e demais eventos da comunidade, foi escolhido o local onde hoje se situa o cruzeiro da igreja, que foi erguido no ano de 1991 e é preservado até os dias de hoje. Nesse mesmo ano, foi criado o Grupo de Jovens JUPAC (Jovens Unidos Pelo Amor de Cristo), que se destacou como um dos grupos de grande expressão na comunidade e com forte vida missionária, contribuindo para a formação de futuras comunidades na região e de outros grupos de jovens.

Em janeiro de 1992, a Congregação das Irmãs de Nossa Senhora (Notre Dame) iniciou sua missão no bairro. As primeiras missionárias a se instalarem foram as Irmãs Silvana, Teresa e Dionízia. Com a motivação das irmãs e a presença dos missionários padres redentoristas, a comunidade ficou ainda mais incentivada na vida comunitária e na vivência da fé. Nesse período, antes mesmo da comunidade se tornar paróquia, já se iniciavam os encontros formativos, as atividades pastorais e a fundação de diversos movimentos. Muitas conquistas do bairro e da comunidade foram alcançadas por meio da mobilização das lideranças da Comunidade Santo Antônio.

Com a chegada constante de pessoas no bairro, surgiu a necessidade de formar outras comunidades em áreas mais afastadas. Todas as novas comunidades surgiram a partir de grupos de famílias que já atuavam nessas áreas. Assim, foram criadas as seguintes comunidades: Nossa Senhora de Guadalupe (1993), Nossa Senhora da Guia (1993), Santa Júlia Billiart (1996), Santa Luzia (2000), São Miguel (2007), Sagrada Família (2007) e Santo Estêvão (2011). Vale ressaltar que as duas últimas comunidades mencionadas tiveram suas atividades encerradas.

Em 1995, foram realizadas na comunidade as Santas Missões Populares, um evento que marcou intensamente a comunidade e representou um forte momento de vivência da dimensão missionária. Um ano depois, em 1996, foi fundada a Arquidiocese de Palmas, e a comunidade passou a integrar a recém-criada Paróquia Nossa Senhora Aparecida, em Taquaralto.

No ano de 2001, a Comunidade se preparou por meio de novenas para a transição de Comunidade para Paróquia e para a recepção do pároco Pe. Marcus Paulo Alves Silva. Após toda a espera e preparação, no dia 17 de fevereiro de 2002, foi celebrada a missa de fundação da Paróquia Santo Antônio, e toda a comunidade festejou com alegria. Inicialmente, a Paróquia Santo Antônio abrangia não apenas as comunidades do Aureny III, mas também as dos bairros Aureny I, II e IV. Posteriormente, foram instituídas paróquias nestes bairros.

Em 2023, após 21 anos de fundação, ocorreram alterações significativas na história da Paróquia Santo Antônio. Em março de 2023, houve o desmembramento de parte do território que pertencia à Paróquia Santo Antônio, formando a nova Área Pastoral Missionária São José de Anchieta. No mesmo ano, em junho, o nome da paróquia foi alterado de Paróquia Santo Antônio para Santo Antônio de Lisboa. Essa mudança atendeu a um pedido da comunidade paroquial, com o objetivo de facilitar a identificação da paróquia, uma vez que já existia outra Paróquia Santo Antônio em Palmas. Também em junho, no dia 11, foi concedido o direito real de uso do território da matriz paroquial por um período de 20 anos.

Foram párocos da Paróquia Santo Antônio de Lisboa: Pe. Marcus Paulo Alves Silva (2002-2006), Pe. Mariano Sousa Sobrinho (2006-2008), Pe. Paulo Cristiano Luiz Frade (2009-2013), Pe. Edionilson Batista (2014-2020) e Pe. Carlos Adriano Sales Fernandes (2020-atualmente).

Este é um breve resumo de uma bela história construída por muitas mãos e corações dedicados ao trabalho de evangelização e à construção do Reino de Deus, história que possibilitou e continua possibilitando tornar Jesus Cristo conhecido, amado e seguido por muitas pessoas.